Szanowni Państwo,
Poniżej znajdują się oferty wolnych pozycji dla doktorantów w rekrutacji 2025/2026. Jeśli zainteresuje Państwa któraś z ofert, proszę o kontakt z osobą wskazaną w ogłoszeniu, lub z kierownikiem danego zakładu
Szanowni Państwo,
Poszukuję doktoranta/ doktorantów. Projekt doktorski będzie dotyczył zagadnień związanych z oddziaływaniami pomiędzy komórkami nowotworowymi (czerniak, rak jelita grubego) a komórkami mikrośrodowiska nowotworowego. W trakcie badań zwrócimy szczególną uwagę na wpływ adipocytów (komórki tłuszczowe), obecnych w otoczeniu guza, na jego progresję, co jest istotne zwłaszcza w kontekście otyłości. Istotnym badanym przez nas zagadnieniem jest również wyjaśnienie molekularnych przyczyn lekooporności czerniaka na tle oddziaływań międzykomórkowych w niszy nowotworowej.
Chciałabym zauważyć, że nasze badania zostały w bieżącym roku docenione przez Ministra Nauki i Szkolnictwa Wyższego, który przyznał mojemu zespołowi nagrodę naukową. W skład wyróżnionego zespołu wchodzili również moi doktoranci.
Prof. dr hab. Dorota Nowak
1 i 2. Doktoranci w Zakładzie Chemii Biologicznej Wydziału Biotechnologii. U.Wr.
Dziekan Wydziału Biotechnologii Uniwersytetu Wrocławskiego ogłasza konkurs na dwa stanowiska Doktoranta-Stypendysty do Zakładu Chemii Biologicznej w ramach projektu Narodowego Centrum Nauki OPUS (nr 2024/53/B/ST4/01386) pt. „Podstawy nieznanej chemii bionieorganicznej cynku: Koordynacja sekwencji, struktury i stabilności w celu zwiększenia funkcjonalności białek cynkowych”, którego kierownikiem jest prof. Artur Krężel.
INSTYTUCJA: Wydział Biotechnologii, Uniwersytet Wrocławski, Zakład Chemii Biologicznej (kierownik prof. Artur Krężel)
STANOWISKO: doktorant stypendysta
TERMIN SKŁADANIA OFERT: 31.07.2025 r.
WYMAGANIA:
- tytuł zawodowy magistra chemii, biotechnologii, biologii lub pokrewny
- zakwalifikowanie się do szkoły doktorskiej Uniwersytetu Wrocławskiego
- mile widziane doświadczenie w pracy z białkami lub peptydami (nadprodukcja w systemie bakteryjnym, synteza peptydów oraz ich modyfikacje, oczyszczanie, badania strukturalne itp.)
- mile widziana znajomość nowoczesnych technik spektroskopowych oraz spektrometrii mas
- dobra znajomość języka angielskiego umożliwiająca swobodną pracę ze źródłami pisanymi oraz przygotowanie publikacji i wystąpień publicznych a także kontakt z obcokrajowcami
- silna motywacja do pracy naukowej, pełne zaangażowanie w realizację zaplanowanych zadań, kreatywność w rozwiązywaniu problemów, samodzielność, umiejętność pracy w zespole
OPIS ZADAŃ:
Głównym celem projektu jest zbadanie zależności pomiędzy sekwencją, strukturą a funkcją zachodzących w białkach cynkowych podlegających zmianom pod wpływem wewnątrzkomórkowych fluktuacji labilnego Zn(II). Białka te różnią się od powszechnie znanych białek cynkowych ze względu na zmiany w resztach koordynujących Zn(II), a także otaczające reszty sekwencyjne i elementy strukturalne. Dlatego naszym celem jest wyjaśnienie aspektów strukturalnych i termodynamicznych, które leżą u podstaw ewolucyjnej presji na uzyskanie takich miejsc, które są powszechnie wykorzystywane w komórce do pełnienia funkcji regulacyjnych. Poprzez dokładne analizy chemiczne, biofizyczne i strukturalne staramy się odkryć ukryte czynniki, które determinują dedykowaną funkcjonalność komórkową. Zrozumienie zasad determinujących działanie białek cynkowych jest istotne z punktu widzenia
nauk podstawowych i biotechnologii, inżynierii białek i projektowania leków opartych na białkach. Znajomość całego spektrum mechanizmów napędzających dynamiczną aktywność białek cynkowych jest niezbędna do zrozumienia nieuchwytnych i trudnych do zbadania mechanizmów sygnalizacji cynkowej, w których aktywność białek regulatorowych jest dostrajana z powodów fizjologicznych lub patologicznych.
Projekt jest wysoce interdyscyplinarny i stwarza kandydatom szansę na rozwój zarówno w obszarze chemicznym, biochemicznym, jak i biologii komórki. Nasz zespół posiada bardzo duże doświadczenie w pracy nad metalobiałkami, określaniem ich struktury, stabilności oraz mechanizmów fałdowania i interakcji z innymi biomolekułami. Oferujmy pracę na unikatowym i bardzo nowoczesnym sprzęcie badawczym oraz szansę poznania szerokiego wachlarza technik z zakresu spektroskopii, spektrometrii mas, chemii biologicznej, biologii molekularnej, syntezy peptydów, produkcji i oczyszczania białek, a także prezentacji swoich wyników na międzynarodowych konferencjach naukowych.
WARUNKI ZATRUDNIENIA:
Stypendium naukowe finansowane ze Szkoły Doktorskiej U.Wr. plus dodatkowe stypendium ze środków NCN w wysokości 5000 zł. Data rozpoczęcia pracy: 1 październik 2025 r.
Stypendium jest przyznawane zgodnie z zasadami zawartymi w Regulaminie przyznawania stypendiów naukowych NCN w projektach badawczych finansowanych ze środków Narodowego Centrum Nauki wprowadzonym uchwałą Rady Narodowego Centrum Nauki nr 25/2024 z dnia 4 marca 2024 r.
FORMA SKŁADANIA OFERT:
Pytania dot. ogłoszenia oraz dokumenty powinny być nadsyłane na
adres kierownika projektu, prof. dr hab. Artura Krężla: e-mail: artur.krezel@uwr.edu.pl
DODATKOWE INFORMACJE:
Wymagane dokumenty:
- Życiorys
- List motywacyjny
- Odpis dyplomu ukończenia studiów I i II stopnia lub studiów jednostopniowych (chemia, biotechnologia lub pokrewne)
- Informacja o średniej ocen egzaminacyjnych z I i II stopnia studiów
- Dane kontaktowe osób mogących udzielić opinii
- Informacje o doświadczeniu w pracy badawczej i zainteresowaniach naukowych
- Oświadczenie kandydata o wyrażeniu zgody na przetwarzanie danych osobowych:
„Wyrażam zgodę na przetwarzanie moich danych osobowych w celach organizacji i przeprowadzenia konkursu oraz udostępnienia informacji o wynikach konkursu. Przyjmuję do wiadomości, iż administratorem danych osobowych jest Uniwersytet Wrocławski, plac Uniwersytecki 1, 50-137 Wrocław. Posiadam wiedzę, że podanie danych jest dobrowolne, jednak konieczne do realizacji celów, w jakim zostały zebrane (zgodnie z Ustawą z dnia 10 maja 2018 roku o ochronie danych osobowych, Dz. U. z 2018r. poz. 1000)”.
Podstawa prawna:
Rozporządzenie Parlamentu Europejskiego i Rady Unii Europejskiej z 2016/679 z dnia 27 kwietnia 2016 r. w sprawie ochrony osób fizycznych w związku z przetwarzaniem danych osobowych i w sprawie swobodnego przepływu takich danych oraz uchylenia dyrektywy 95/46/W (ogólne rozporządzenie o ochronie danych) oraz Ustawa z dnia 10 maja 2018 roku o ochronie danych osobowych (Dz. U. z 2018r. poz. 1000).
Przykładowe publikacje z grupy badawczej: Pomorski et al. (2025) Anal Chim Acta. 1337, 343550; Peris-Diaz et al. (2024) J Proteome Res. 23, 3626-3637; Mosna K. (2023) Metallomics. 15, mfad061; Kluska et al. (2022) Angew. Chem. Int. Ed. 61: e202116621; Peris-Diaz et al. (2021) J. Am. Chem. Soc. 143, 16486; Kocyła et al. (2021) Trends Biochem Sci. 46, 64; Krężel and Maret (2021) Chem. Rev. 121, 14594; Santoro et al. (2020) Angew. Chem. Int. Ed., 59, 7830; Peris-Diaz et al. (2020) Anal. Chem. 92, 12950; Padjasek et al. (2020) Chemistry, Kocyła et al. (2018) Chem. Commun. 54, 13539; Kortner et al. (2018) Bioorg. Med. Chem.26, 2610; Drozd et al. (2018) Metallomics 10, 595; Bohl et al. (2017) FASEB J. 31, 5258. Kochańczyk et al. (2016) Sci. Rep. 6, 36346. Park et al. (2017), Nat. Struct. Mol. Biol. 24, 248; Wezynfeld et al. (2016) Angew. Chem. Int. Ed., 55, 8235.
3. Doktorant w projekcie Sonata pt. „Zależna od Zn2+ kompetycja pomiędzy korecepotorem CD4 a CD8α o kinazę tyrozynową Lck”, którego kierownikiem jest dr Anna Kocyła.
Dziekan Wydziału Biotechnologii Uniwersytetu Wrocławskiego ogłasza konkurs na stanowisko Doktoranta-Stypendysty do Zakładu Chemii Biologicznej w ramach projektu Narodowego Centrum Nauki Sonata pt. „Zależna od Zn2+ kompetycja pomiędzy korecepotorem CD4 a CD8α o kinazę tyrozynową Lck”, którego kierownikiem jest dr Anna Kocyła.
INSTYTUCJA: Wydział Biotechnologii, Uniwersytet Wrocławski, Zakład Chemii Biologicznej (kierownik dr Anna Kocyła)
STANOWISKO: doktorant stypendysta
TERMIN SKŁADANIA OFERT: 15.08.2025 r.
WYMAGANIA:
- tytuł zawodowy magistra chemii, biotechnologii, biologii lub pokrewny
- zakwalifikowanie się do szkoły doktorskiej Uniwersytetu Wrocławskiego
- mile widziane doświadczenie w pracy z białkami lub peptydami (otrzymywanie białek rekombinowanych, synteza chemiczna peptydów, badania biofizyczne oraz biochemiczne)
- mile widziana znajomość technik biologii molekularnej, systemu prezentacji oraz selekcji białek na powierzchni drożdży, cytometrii przepływowej, prowadzenia kultur komórkowych
- dobra znajomość języka angielskiego umożliwiająca swobodną pracę ze źródłami pisanymi, przygotowanie publikacji i wystąpień publicznych oraz kontakt z obcokrajowcami
- silna motywacja do pracy naukowej, pełne zaangażowanie w realizację zaplanowanych zadań, kreatywność w rozwiązywaniu problemów, samodzielność
OPIS ZADAŃ:
Celem projektu jest zrozumienie mechanizmu konkurencji i współdziałania koreceptorów CD4 i CD8α w wiązaniu z kinazą Lck w zależności od obecności jonów Zn²⁺. Oddziaływanie to jest niezbędne we wczesnej fazie aktywacji limfocytów T oraz w ich różnicowaniu. Realizacja projektu obejmuje szczegółową charakterystykę biofizyczną wiązania Zn²⁺ do wariantów sekwencyjnych CD8α oraz Lck, co pozwoli wyodrębnić kluczowe elementy stabilizujące ten kompleks. W dalszej części projektu zbadana zostanie konkurencja pomiędzy CD4 i CD8α o Lck w roztworze oraz z wykorzystaniem modelowych błon komórkowych. Ponadto projekt obejmuje uzyskanie drożdżowych bibliotek wariantów CD4 oraz CD8α oraz ich selekcję w kontekście zależnego od Zn2+ powinowactwa do Lck. W końcowych etapie planowane jest odtworzenie kaskady sygnałowej receptora limfocytów T dla wybranych wariantów CD4 oraz CD8α z udziałem CD3ζ oraz tSH2 kinazy Zap70.
Projekt oferuje szerokie możliwości rozwoju w dziedzinie m.in. biologii strukturalnej i biofizyki białek. Doktorant będzie produkować, oczyszczać oraz charakteryzować białka i peptydy z wykorzystaniem technik spektroskopowych oraz spektrometrii mas. Będzie zaangażowany w rozwój metod selekcji białek przy użyciu prezentacji powierzchniowej na drożdżach (m.in. nauka tworzenia bibliotek drożdżowych, praca techniką cytometrii przepływowej), produkcję i badanie oddziaływań międzybiałkowych na modelowych membranach (m.in. techniką spektroskopii fluorescencyjnej z użyciem pomiarów czasu życia fluorescencji) oraz analizę mutantów białkowych w systemach modelowych oraz komórkowych. Udział w projekcie umożliwi zdobycie szerokiego wachlarza umiejętności eksperymentalnych oraz wiedzy z zakresu interakcji białko-białko regulowanych przez jony metali, co może mieć zastosowanie w badaniach nad układem odpornościowym i nowoczesnymi terapiami immunologicznymi.
WARUNKI ZATRUDNIENIA:
Stypendium naukowe finansowane ze Szkoły Doktorskiej UWr plus dodatkowe stypendium ze środków Narodowego Centrum Nauki. Data rozpoczęcia pracy: 1 października 2025 r.
Stypendium jest przyznawane zgodnie z zasadami zawartymi w Regulaminie przyznawania stypendiów naukowych NCN w projektach badawczych finansowanych ze środków Narodowego Centrum Nauki wprowadzonym uchwałą Rady Narodowego Centrum Nauki nr 25/2024 z dnia 4 marca 2024 r.
FORMA SKŁADANIA OFERT:
Pytania dotyczące ogłoszenia oraz dokumenty proszę wysyłać na adres kierownika projektu, dr Anny Kocyły: e-mail: anna.kocyla@uwr.edu.pl
DODATKOWE INFORMACJE:
Wymagane dokumenty:
- Życiorys
- List motywacyjny
- Odpis dyplomu ukończenia studiów I i II stopnia lub studiów jednostopniowych (chemia, biotechnologia lub pokrewne)
- Informacja o średniej ocen egzaminacyjnych z I i II stopnia studiów
- Dane kontaktowe osób mogących udzielić opinii
- Informacje o doświadczeniu w pracy badawczej i zainteresowaniach naukowych
- Oświadczenie kandydata o wyrażeniu zgody na przetwarzanie danych osobowych:
„Wyrażam zgodę na przetwarzanie moich danych osobowych w celach organizacji i przeprowadzenia konkursu oraz udostępnienia informacji o wynikach konkursu. Przyjmuję do wiadomości, iż administratorem danych osobowych jest Uniwersytet Wrocławski, plac Uniwersytecki 1, 50-137 Wrocław. Posiadam wiedzę, że podanie danych jest dobrowolne, jednak konieczne do realizacji celów, w jakim zostały zebrane (zgodnie z Ustawą z dnia 10 maja 2018 roku o ochronie danych osobowych, Dz. U. z 2018r. poz. 1000)”.
Podstawa prawna:
Rozporządzenie Parlamentu Europejskiego i Rady Unii Europejskiej z 2016/679 z dnia 27 kwietnia 2016 r. w sprawie ochrony osób fizycznych w związku z przetwarzaniem danych osobowych i w sprawie swobodnego przepływu takich danych oraz uchylenia dyrektywy 95/46/W (ogólne rozporządzenie o ochronie danych) oraz Ustawa z dnia 10 maja 2018 roku o ochronie danych osobowych (Dz. U. z 2018r. poz. 1000).
Klauzula informacyjna RODO
1. Administratorem Pani/Pana danych osobowych jest Uniwersytet Wrocławski z siedzibą przy Pl. Uniwersytecki 1, 50-137 Wrocław;
2. Administrator danych osobowych powołał administratora bezpieczeństwa informacji nadzorującego prawidłowość przetwarzania danych osobowych;
3. Pani/Pana dane osobowe przetwarzane będą w celu organizacji i przeprowadzenia konkursu;
4. Podstawą do przetwarzania danych osobowych jest zgoda na przetwarzanie danych osobowych;
5. Podanie danych jest dobrowolne, jednak konieczne do realizacji celów, do jakich zostały zebrane;
6. Dane nie będą udostępniane podmiotom zewnętrznym z wyjątkiem przypadków przewidzianych przepisami prawa;
7. Dane przechowywane będą przez okres niezbędny do realizacji wyżej określonych celów;
8. Posiada Pani/Pan prawo dostępu do treści swoich danych oraz z zastrzeżeniem przepisów prawa: prawo ich sprostowania, usunięcia, ograniczenia przetwarzania, prawo do przenoszenia danych, prawo do wniesienia sprzeciwu, prawo do cofnięcia zgody w dowolnym momencie.
Dziekan Wydziału Biotechnologii Uniwersytetu Wrocławskiego ogłasza konkurs na stanowisko Doktoranta-Stypendysty do Zakładu Biologii Molekularnej Komórki w ramach projektu Narodowego Centrum Nauki OPUS pt. „Kontrola jakości mitochondriów u roślin: określenie zależności pomiędzy mitofagią a proteazą FTSH4 wewnętrznej błony mitochondrialnej na przykładzie Arabidopsis thaliana”, kierowanego przez dr hab. Małgorzatę Heidorn-Czarną.
Typ konkursu Narodowego Centrum Nauki: OPUS, edycja konkursu 27
Nazwa jednostki: Uniwersytet Wrocławski, Wydział Biotechnologii
Nazwa stanowiska: Doktorant-Stypendysta
Poszukujemy studenta doktoranta do współpracy w realizacji projektu badawczego NCN OPUS dotyczącego określenia roli proteazy FTSH4 wewnętrznej błony mitochondrialnej w procesie mitofagii u roślin. Projekt kierowany jest przez dr hab. Małgorzatę Heidorn-Czarną i realizowany w Zakładzie Biologii Molekularnej Komórki.
Wymagania:
- Posiadanie dyplomu magistra biologii lub biotechnologii
- Uczestnik Kolegium Doktorskiego Nauk Biomedycznych Szkoły Doktorskiej Uniwersytetu Wrocławskiego w dyscyplinie naukowej Biotechnologia
- Wiedza z zakresu biologii komórki, biochemii i biologii molekularnej
- Znajomość podstawowych technik biologii molekularnej i biochemii
- Dobra znajomość jęz. angielskiego
- Motywacja do pracy naukowej, umiejętność planowania eksperymentów, zaangażowanie w realizację zaplanowanych badań, samodzielność
- Umiejętność pracy w zespole
Dodatkowymi atutami będą:
- Praca magisterska z zakresu biologii lub biochemii roślin, zwłaszcza Arabidopsis thaliana
- Doświadczenie laboratoryjne, szczególnie w zakresie klonowania molekularnego, analizy białek i analiz mikroskopowych
- Odbyte staże naukowe krajowe i zagraniczne
- Aktywny udział w konferencjach naukowych
- Publikacje naukowe
Opis zadań:
Celem projektu jest określenie, w jaki sposób proteaza FTSH4 wewnętrznej błony mitochondrialnej Arabidopsis thaliana uczestniczy w procesie mitofagii, a przez to zrozumienie funkcjonalnego związku między mitochondrialnym systemem proteolitycznym a selektywną autofagią u roślin.
Praca badawcza będzie wykonywana w Zakładzie Biologii Molekularnej Komórki Wydziału Biotechnologii Uniwersytetu Wrocławskiego we Wrocławiu w ramach projektu NCN OPUS 27 nr 2024/53/B/NZ3/00722.
Do zadań doktoranta lub doktorantki należeć będą:
- Przygotowanie konstruktów genetycznych
- Transformacja i krzyżowanie roślin, selekcja i analiza roślin transgenicznych
- Określenie formowania mitofagosomów w oparciu o testy biochemiczne, mikroskopię konfokalną i transmisyjny mikroskop elektronowy
- Określenie interakcji między FTSH4 i przypuszczalnymi receptorami mitofagii, a także między ATG8 i wybranymi receptorami mitochondrialnymi na drodze analiz BiFC
- Izolacja frakcji mitofagosomalnych do analiz za pomocą spektrometrii mas
- Testy aktywności proteasomu, poziomu ubikwityny i reakcje qRT-PCR
- Analiza i interpretacja danych
- Udział w przygotowaniu publikacji naukowych
- Prezentacja wyników na konferencjach naukowych
Termin składania ofert: 30 czerwca 2025 r.
Rozstrzygnięcie konkursu: 19 września 2025 r.
Forma składania ofert: e-mail
Warunki zatrudnienia:
1. Okres 6 miesięcy z możliwością przedłużenia na kolejne pół roku
2. Planowane rozpoczęcie pracy w ramach projektu: 1 października 2025 r.
Stypendium jest przyznawane zgodnie z zasadami zawartymi w Regulaminie przyznawania stypendiów naukowych NCN w projektach badawczych finansowanych ze środków Narodowego Centrum Nauki wprowadzonym uchwałą Rady Narodowego Centrum Nauki nr 25/2024 z dnia 4 marca 2024 r.
Dodatkowe informacje:
Zgłoszenie powinno zawierać następujące dokumenty:
- List motywacyjny
- Życiorys zawierający informacje o dotychczasowej działalności naukowej i osiągnięciach
- Kopie dyplomów ukończenia studiów
- Wykaz publikacji i prezentacji konferencyjnych
- Dane kontaktowe o osobach, które mogą udzielić rekomendacji
Kandydat oceniany będzie przede wszystkim pod kątem kompetencji do realizacji zadań określonych w projekcie oraz innych osiągnięć naukowych zgodnie z regulaminem NCN przyznawania stypendium doktorskich w ramach projektów OPUS. Kandydaci mogą zostać zaproszeni na rozmowę kwalifikacyjną. O terminie rozmowy kwalifikacyjnej wybrani kandydaci zostaną powiadomieni indywidualnie.
Forma składania ofert:
email na adres: malgorzata.czarna@uwr.edu.pl z dopiskiem STYPENDIUM 1 OPUS 27.
Klauzula informacyjna RODO
1. Administratorem Pani/Pana danych osobowych jest Uniwersytet Wrocławski z siedzibą przy Pl. Uniwersytecki 1, 50-137 Wrocław;
2. Administrator danych osobowych powołał administratora bezpieczeństwa informacji nadzorującego prawidłowość przetwarzania danych osobowych;
3. Pani/Pana dane osobowe przetwarzane będą w celu organizacji i przeprowadzenia konkursu;
4. Podstawą do przetwarzania danych osobowych jest zgoda na przetwarzanie danych osobowych;
5. Podanie danych jest dobrowolne, jednak konieczne do realizacji celów, do jakich zostały zebrane;
6. Dane nie będą udostępniane podmiotom zewnętrznym z wyjątkiem przypadków przewidzianych przepisami prawa;
7. Dane przechowywane będą przez okres niezbędny do realizacji wyżej określonych celów;
8. Posiada Pani/Pan prawo dostępu do treści swoich danych oraz z zastrzeżeniem przepisów prawa: prawo ich sprostowania, usunięcia, ograniczenia przetwarzania, prawo do przenoszenia danych, prawo do wniesienia sprzeciwu, prawo do cofnięcia zgody w dowolnym momencie;
Oświadczenie o wyrażeniu zgody na przetwarzanie danych osobowych
„Wyrażam zgodę na przetwarzanie moich danych osobowych w celach organizacji i przeprowadzenia konkursu oraz udostępnienia informacji o wynikach konkursu. Przyjmuję do wiadomości, iż administratorem danych osobowych jest Uniwersytet Wrocławski, plac Uniwersytecki 1, 50-137 Wrocław. Posiadam wiedzę, że podanie danych jest dobrowolne, jednak konieczne do realizacji celów, w jakim zostały zebrane (zgodnie z Ustawą z dnia 10 maja 2018 roku o ochronie danych osobowych, Dz. U. z 2018r. poz. 1000)”.
Podstawa prawna:
Rozporządzenie Parlamentu Europejskiego i Rady Unii Europejskiej z 2016/679 z dnia 27 kwietnia 2016 r. w sprawie ochrony osób fizycznych w związku z przetwarzaniem danych osobowych i w sprawie swobodnego przepływu takich danych oraz uchylenia dyrektywy 95/46/W (ogólne rozporządzenie o ochronie danych) oraz Ustawa z dnia 10 maja 2018 roku o ochronie danych osobowych (Dz. U. z 2018r. poz. 1000).
Poszukujemy ambitnej kandydatki/kandydata do dołączenia do naszego młodego i intensywnie rozwijającego się zespołu Zakładu Biotechnologii Medycznej (https://zaklad.biotechnologii.medycznej.uwr.edu.pl) do realizacji innowacyjnego projektu badawczego PROT-TOWING, mającego na celu opracowanie nowatorskiej technologii selektywnej inaktywacji białek chorobotwórczych (https://biotechnologia.pl/biotechnologia/wroclawski-badacz-z-grantem-na-innowacyjna-technologie-molekularnego-holowania-do-selektywnej-inaktywacji-chorobotworczych-bialek,23785), która może posłużyć w przyszłości do projektowania leków na do tej pory nieuleczalne choroby.
Projekt realizowany będzie w ramach dużego grantu Fundacji na Rzecz Nauki Polskiej przy wsparciu środków unijnych, we współpracy z firmą Captor Therapeutics SA oraz Uniwersytetem w Groningen, Holandia.
Doktorant oprócz podstawowego stypendium w szkole doktorskiej będzie przez 4 lata otrzymywał konkurencyjne stypendium doktoranckie FNP.
Zainteresowane osoby proszone są o kontakt z prof. dr hab. Łukaszem Opalińskim (lukasz.opalinski@uwr.edu.pl)
Dziekan Wydziału Biotechnologii Uniwersytetu Wrocławskiego ogłasza konkurs na stanowisko Doktoranta – Stypendysty do Zakładu Biochemii Genetycznej w ramach projektu Narodowego Centrum Nauki OPUS pt. „Ustalenie roli enzymów grzybowych rozkładających polimery ściany komórkowej roślin w procesie kolonizacji i uczulania lnu przez niepatogenny szczep Fusarium oxysporum”, kierowanego przez dr Wioletę Wojtasik-Górną.
Typ konkursu NCN: OPUS27 – NZ9
Nazwa jednostki: Uniwersytet Wrocławski, Wydział Biotechnologii, Wrocław
Nazwa stanowiska: Doktorant-stypendysta
Poszukujemy studenta doktoranta do współpracy w realizacji projektu badawczego NCN OPUS dotyczącego badania roli enzymów grzybowych rozkładających polimery ściany komórkowej roślin w procesie kolonizacji i uczulania lnu przez niepatogenny szczep Fusarium oxysporum, kierowanego przez dr Wioletę Wojtasik-Górną, realizowanego w Zakładzie Biochemii Genetycznej.
Wymagania:
- Wykształcenie: absolwent (-ka) kierunków biologia, biotechnologia lub pokrewnych.
- Zakwalifikowanie się do szkoły doktorskiej Uniwersytetu Wrocławskiego.
- Wiedza z zakresu biologii molekularnej, biochemii, biotechnologii.
- Znajomość technik biologii molekularnej, metod analitycznych, technik mikroskopowych.
- Mile widziana wiedza z zakresu biologii molekularnej roślin, w tym interakcji roślina-grzyb.
- Mile widziane doświadczenie w pracy z roślinami i grzybami oraz w przygotowywaniu konstruktów genowych i transformacji genetycznej.
- Znajomość języka angielskiego umożliwiająca swobodną pracę ze źródłami pisanymi oraz przygotowanie publikacji i wystąpień publicznych.
- Motywacja do pracy naukowej, pełne zaangażowanie w realizację zaplanowanych badań, kreatywność w rozwiązywaniu problemów, samodzielność, umiejętność pracy w zespole.
Opis zadań:
Celem projektu jest poznanie molekularnych mechanizmów działania niepatogennego F. oxysporum (Fo47) w procesach kolonizacji i uczulania lnu. Realizacja projektu będzie obejmowała następujące etapy. Ze względu na złożoność tych procesów w projekcie skupimy się na jednej grupie białek, która może odgrywać w nich kluczową rolę. Są to enzymy degradujące polimery ściany komórkowej roślin, których działanie ułatwia penetracje tkanek roślinnych, dostarcza wolne glikany wykorzystywane przez grzyba jako źródło energii lub elementy budulcowe i jednocześnie uwalnia elicitory aktywujące szlaki odpowiedzi obronnej roślin. Zarówno niepatogenne, jak i patogenne szczepy grzybów wydzielają enzymy degradujące polimery ściany komórkowej roślin, ale kolonizacja roślin przez te dwa szczepy różni się, co może wynikać z odmiennej ekspresji genów tych białek. Pierwszym etapem będzie identyfikacja celów molekularnych do modyfikacji Fo47. Zostanie wykonana analiza porównawcza transkryptomów grzybów Fo47 i Foln z lnu traktowanego tymi grzybami, na podstawie której wybrane zostaną różnicujące transkrypty. Następnie porównane zostaną sekwencje promotorowe odpowiadających im genów w celu oceny, czy obserwowane różnice mogą być związane ze zróżnicowaniem tych sekwencji. W drugim etapie przygotowane zostaną konstrukty genowe do wyciszania wybranych genów, a następnie wytworzone transgeniczne szczepy grzyba Fo47 z obniżoną ekspresją docelowych genów. Kolejno, w trzecim etapie transgeniczne grzyby o zmienionych właściwościach wykorzystane zostaną do określenia funkcji wybranych białek w procesie kolonizacji i uczulania. Rośliny lnu będą traktowane grzybami, a następnie w wielu różnych punktach czasowych będziemy monitorować postęp kolonizacji m. in. przez obserwacje makroskopowe i mikroskopowe oraz zawartość materiału genetycznego grzybów. Ostatnim etapem będzie sprawdzenie czy mechanizmy epigenetyczne (metylacja DNA, metylacja i acetylacja histonów, milRNA) regulują ekspresję wybranych genów w niepatogennym i patogennym szczepie F. oxysporum.
Więcej informacji: https://projekty.ncn.gov.pl/opisy/618672-pl.pdf
Do zadań doktoranta będzie należało:
- przygotowanie materiału badawczego roślin lnu traktowanych niepatogennymi i/lub patogennymi grzybami, a następnie analiza uzyskanych roślin (analiza fenotypowa i mikroskopowa),
- przygotowanie konstruktów genowych do wyciszenia genów grzybowych kodujących enzymy rozkładające polimery ściany komórkowej roślin i transformacja niepatogennego i patogennego F. oxysporum,
- selekcja i analiza transformantów; traktowanie roślin lnu transgenicznymi grzybami i analiza fenotypowa oraz monitorowanie postępu kolonizacji,
- analiza metylacja DNA i modyfikacji histonów wybranych genów.
- analiza i interpretacja danych.
Termin składania ofert: 15.08.2025 23:59
Rozstrzygnięcie konkursu: 29.08.2025
Forma składania ofert oraz zapytań: e-mail adres kierownika projektu: wioleta.wojtasik@uwr.edu.pl lub osobiście dodr Wiolety Wojtasik-Górnej, Wydział Biotechnologii, UWr, Zakład Biochemii Genetycznej Przybyszewskiego 63,Wrocław, z dopiskiem „Stypendium OPUS
Wybrani Kandydaci mogą zostać poproszeni o przybycie na rozmowę kwalifikacyjną. O terminie rozmowy kwalifikacyjnej wybrani kandydaci zostaną powiadomieni indywidualnie.
Stypendium jest przyznawane zgodnie z zasadami zawartymi w Regulaminie przyznawania stypendiów naukowych NCN w projektach badawczych finansowanych ze środków Narodowego Centrum Nauki wprowadzonym uchwałą Rady Narodowego Centrum Nauki nr 25/2024 z dnia 4 marca 2024 r.
Warunki zatrudnienia:
1. Stypendium naukowe finansowane ze Szkoły Doktorskiej U.Wr. plus dodatkowe stypendium ze środków NCN w wysokości 3 000 zł/m-c.
2. Okres: 6 miesięcy z możliwością przedłużenia do końca trwania projektu.
3. Planowane rozpoczęcie pracy w ramach projektu: 1 października 2025.
Dodatkowe informacje:
Oferta powinna zawierać następujące dokumenty:
- CV
- list motywacyjny
- odpis dyplomu ukończenia studiów II stopnia lub studiów jednostopniowych
- osiągnięcia naukowe, w tym: wykaz publikacji, aktywność w ramach studenckiego ruchu naukowego, udział w projektach badawczych
- dane kontaktowe o osobach, które mogą udzielić rekomendacji.
Kandydat oceniany będzie przede w pod kątem kompetencji do realizacji zadań określonych w projekcie oraz innych osiągnieć naukowych.
Klauzula informacyjna RODO
1. Administratorem Pani/Pana danych osobowych jest Uniwersytet Wrocławski z siedzibą przy Pl. Uniwersytecki 1, 50-137 Wrocław;
2. Administrator danych osobowych powołał administratora bezpieczeństwa informacji nadzorującego prawidłowość przetwarzania danych osobowych;
3. Pani/Pana dane osobowe przetwarzane będą w celu organizacji i przeprowadzenia konkursu;
4. Podstawą do przetwarzania danych osobowych jest zgoda na przetwarzanie danych osobowych;
5. Podanie danych jest dobrowolne, jednak konieczne do realizacji celów, do jakich zostały zebrane;
6. Dane nie będą udostępniane podmiotom zewnętrznym z wyjątkiem przypadków przewidzianych przepisami prawa;
7. Dane przechowywane będą przez okres niezbędny do realizacji wyżej określonych celów;
8. Posiada Pani/Pan prawo dostępu do treści swoich danych oraz z zastrzeżeniem przepisów prawa: prawo ich sprostowania, usunięcia, ograniczenia przetwarzania, prawo do przenoszenia danych, prawo do wniesienia sprzeciwu, prawo do cofnięcia zgody w dowolnym momencie;
Oświadczenie o wyrażeniu zgody na przetwarzanie danych osobowych
„Wyrażam zgodę na przetwarzanie moich danych osobowych w celach organizacji i przeprowadzenia konkursu oraz udostępnienia informacji o wynikach konkursu. Przyjmuję do wiadomości, iż administratorem danych osobowych jest Uniwersytet Wrocławski, plac Uniwersytecki 1, 50-137 Wrocław. Posiadam wiedzę, że podanie danych jest dobrowolne, jednak konieczne do realizacji celów, w jakim zostały zebrane (zgodnie z Ustawą z dnia 10 maja 2018 roku o ochronie danych osobowych, Dz. U. z 2018r. poz. 1000)”.
Rozporządzenie Parlamentu Europejskiego i Rady Unii Europejskiej z 2016/679 z dnia 27 kwietnia 2016 r. w sprawie ochrony osób fizycznych w związku z przetwarzaniem danych osobowych i w sprawie swobodnego przepływu takich danych oraz uchylenia dyrektywy 95/46/W (ogólne rozporządzenie o ochronie danych) oraz Ustawa z dnia 10 maja 2018 roku o ochronie danych osobowych (Dz. U. z 2018r. poz. 1000).
Szanowni Państwo,
Poszukujemy doktoranta/doktorantów do realizacji zadań badawczych w Zakładzie Biochemii. Projekt doktorski będzie dotyczył badań, które w dużej części będą dotyczyć zamierzeń, opisanych w nowym projekcie badawczym NCN, pt.: Funkcjonalna i strukturalna zależność między procesami biosyntezy nukleotydo-cukrów a metodami ich transportu do subkomórkowego miejsca biosyntezy glikokoniugatów”.
Oczekujemy, że poszukiwany kandydat:
- Będzie posiadał dyplom magistra biologii lub biotechnologii (chociaż pokrewne dziedziny też mogą być akceptowane)
- Miał wiedzę z zakresu biologii komórki, biochemii i biologii molekularnej
- Znał podstawowych technik laboratoryjnych
- Przyzwoicie znał język angielski, na poziomie pozwalającym czytać literaturę naukową
- Najważniejsze – był zmotywowany do pracy naukowej, entuzjazm w pracy oraz umiejętność pracy w zespole jest kluczowym wymogiem do pracy w naszym zespole
Dodatkowymi, aczkolwiek nie obowiązkowymi atutami będą:
- Większe doświadczenie laboratoryjne, szczególnie w zakresie biochemii, technik biologii molekularnej czy enzymologii
- Publikacje naukowe
Termin kontaktu w celu omówienia szczegółów : do 30 sierpnia 2025 r.
Rozmowa kwalifikacyjna dla kandydatów na studia doktoranckie w ramach kolegium doktorskiego nauk biomedycznych, działającego przy Wydziale Biotechnologii:
11-12 września 2025 r.
Prof. dr hab. Mariusz Olczak
Zakład Biochemii
3 piętro, pokoje 3.24-28 oraz przyległe laboratoria
Temat: Zastosowanie terapii genowej w dystrofii mięśniowej Emery-Dreifussa.
Promotorzy: prof. Ryszard Rzepecki, dr Katarzyna Piekarowicz
Opis projektu: Dystrofia mięśniowa Emery-Dreifussa (EDMD) to rzadka, postępująca choroba genetyczna, której przyczyną są mutacje w genach LMNA i EMD, kodujące białka otoczki jądrowej – laminy A/C i emerynę. Wpływ tych mutacji na komórki prekursorowe mięśni (komórki satelitarne) oraz proces miogenezy pozostaje wciąż słabo poznany. Obecnie dostępne są tylko terapie oparte o łagodzenie objawów EDMD, natomiast żadna terapia ukierunkowana na przyczynę choroby nie jest dostępna. Przygotowanie strategii terapii genowej wymaga weryfikacji, na którym etapie miogenezy konieczna jest korekcja ekspresji genu.
Cele projektu
1. Zidentyfikowanie mechanizmów molekularnych zaburzających funkcjonowanie komórek mięśniowych, które w efekcie prowadzą do rozwoju fenotypu chorobowego EDMD.
2. Opracowanie wektora do terapii genowej EDMD typu 1 oraz ocena jego skuteczności w korekcji zmian molekularnych, z wykorzystaniem modeli komórek mięśniowych hodowanych in vitro w układach 2D i 3D.
Metody:
– reprogramowanie fibroblastów pacjentów do iPSCs;
– hodowla indukowanych pluripotentnych komórek macierzystych (iPSCs) oraz ich różnicowanie do komórek mięśniowych in vitro;
– tworzenie i analiza modeli 3D (organoidy mięśniowe);
– analiza ekspresji genów (RNA-seq, qPCR);
– badanie poziomu i lokalizacji białek zaangażowanych w regulację miogenezy (western blot, immunofluorescecja, mikroskopia konfokalna, analizy przyżyciowe), produkcja wektora wirusowego i transdukcja komórek mięśniowych;
– opcjonalnie: analizy bioinformatyczne (ekspresja genów, szlaki sygnalne).
Kontakt: katarzyna.piekarowicz@uwr.edu.pl, Pracownia Białek Jądrowych, Wydział Biotechnologii, KEBB pokój 3.31, 713756419
